Sendromik Olmayan Otizm Spektrum Bozukluğunda Pogz Gen Varyantlarının İncelenmesi

Jülide TOZKIR, Gökberk YILDIRIM, Selma DEMİR, Orkide PALABIYIK, Işık GÖRKER, Hakan GÜRKAN
2024 Eylül - 61 (3)
TÜRKÇE PDF İNGİLİZCE PDF

Öne Çıkan Noktalar

• POGZ geni, OSB’de en sık mutasyona uğrayan genlerden
birisidir.
• POGZ’da rs3831142, rs112072925, rs2274535,
rs142860188 varyantları OSB’de farklıdır.
• POGZ’da belirlenen varyantlar fonksiyonel bölgeleri
kodlayan dizidedir.


Türkçe Özet

Amaç: Otizm spektrum bozukluğunun (OSB) etiyopatogenezinde genetik
faktörler önemli rol oynamaktadır. Literatürde ZNF Alanı Proteinli Pogo
Transposable Element (POGZ) geninin (MIM*614787), OSB’de en sık
mutasyona uğrayan genlerden biri olduğu rapor edilmiştir. Çalışmanın
amacı, sendromik olmayan otizm spektrum bozukluğu (OSB) vakalarında
POGZ geninin ekzonik bölgelerini detaylı bir şekilde analiz etmektir.
Yöntem: Çalışmaya DSM-V tanı kriterlerine göre OSB tanısı alan, yaşları
2–18 arasında değişen, sendromik olmayan 51 vaka dâhil edildi. Sağlıklı
kontrol grubu ise benzer yaş grubunda, nörogelişimsel sorunu olmayan
50 çocuktan oluşturuldu. POGZ geninin en az 50 baz çiftinden mRNA
kodlu bölgelerini kapsayan derin intronik primerler kullanılarak üretilen
amplikonlar, Yeni Nesil Dizileme yöntemi ile analiz edildi.
Bulgular: OSB grubunda açık erişim veritabanlarında (ClinVar, HGMD
vb.) rapor edilen herhangi bir patojenik veya olası patojenik varyant
tespit edilmedi. OSB ve sağlıklı kontrol gruplarında rs113396244,
rs11204811, rs779479223, rs772352054, rs3831142, rs112072925,
rs227453 ve rs142860188 varyantları belirlendi. OSB grubunda
rs3831142, rs112072925, rs2274535, rs142860188 varyantları kontrol
grubuna göre istatistiksel olarak anlamlı bulundu. Belirlenen varyantların
olguların cinsiyetine göre dağılımı istatistiksel olarak anlamlı değildi.
Sonuç: OSB grubunda istatistiksel olarak anlamlı bulunan varyantlar
proteinin HP1-ZNF ve DDE alanlarını kapsayan bölgelerde yer almaktadır.
Özellikle DDE alanının fetal beyin gelişimi ve nörogenezde rol oynadığı
göz önüne alındığında, bu dört varyantın OSB’de düzenleyici ve/veya
predispozan etkilere sahip olabileceği düşünülebilir.
Anahtar Söczükler: Otizm spektrum bozukluğu, POGZ, yeni nesil dizilem